Tecnológias y patentes

• • La patente MX/a/2013/012160 (Titulo 356006) “Proceso para obtener una molécula que sirve como elicitor de péptidos antimicrobianos”
  • La patente MX/a/2014/004496 (Titulo 358788) “Proceso para obtener una molécula que sirve como inhibidor de péptidos antimicrobianos”
  • La patente MX/a/2015/002594 (Titulo 363028) “Lámpara de UVA y UVC para el tratamiento de enfermedades infecciosas y Cáncer de Piel”.
  • Titulo de patente 411325 “Elicitor de péptidos antimicrobianos litocoil oleato como agente antivira”
  • Solicitud de patente Mx/a/2024/002011 ”Proceso mejorado para obtener una molécula que sirve como elicitor de péptidos antimicrobianos”.

Objetivos del LAMPER

I. Promover el desarrollo y consolidación de infraestructura necesaria para impulsar la Medicina Personalizada y de precisión en todo el territorio nacional.

II. Promover el máximo acceso y aprovechamiento público de la infraestructura al alcance del LAMPER.

III. Impulsar la incidencia de la infraestructura en la generación de conocimiento de frontera, desarrollo tecnológico de vanguardia e innovación abierta y la incidencia en la atención de problemas nacionales en el marco de los Programas Nacionales Estratégicos que impulsa el CONACYT a través del LAMPER.

IV. Fomentar la creación y consolidación de infraestructura acorde a las prioridades nacionales en materia de humanidades, ciencias, tecnologías e innovación, a través de objetivos de largo alcance que generen sinergias entre investigadores con habilidades, conocimientos, experiencia e infraestructuras complementarias dentro del saber y alcance del LAMPER.

V. Fomentar la colaboración de los sectores público, social y privado del país, a nivel sectorial, local, estatal, regional, nacional e internacional para impulsar y desarrollar la medicina personalizada y de precisión.

VI. Fortalecer y consolidar a la comunidad académica, humanística, científica, tecnológica y de innovación, promoviendo la participación de las y los humanistas, científicos, tecnólogos e innovadores en diversos procesos relacionados con la vinculación dirigida hacia medicina personalizada y de precisión.

VII. Promover el acceso abierto y público a la información, los datos y el conocimiento que se genere con motivo de la vinculación dirigida hacia medicina personalizada y de precisión.

VIII. Fomentar la concurrencia de recursos para aprovechar e incrementar el potencial de la infraestructura de investigación existente, incluyendo el mantenimiento de instrumental y equipos especializados dirigidos ha los desarrollos de la medicina personalizada y de precisión.

IX. Promover la formación y consolidación humanistas, científicos, tecnólogos e innovadores, fomentando la participación de programas de posgrado nacionales en la vinculación hacia la medicina personalizada y de precisión.

Proyectos actuales

Se iniciaron dos proyectos en el periodo de 2022 y 2023, con los que se montaron dos metodologías de redes neuronales enfocados a encontrar biomarcadores útiles en la medicina preventiva, nutrigenómica y farmacogenómica, abriendo la posibilidad para que el LAMPER ofrezca nuevos servicios basados en las ómicas

• CF-2023-G-994 “Identificación de biomarcadores personalizados por métodos de aprendizaje profundo aplicable en diagnóstico y seguimiento de meduloblastoma en poblaciones pediátricas.

Parte del proyecto enfoca los resultados hacia el uso de métodos de diagnóstico y farmacogenética para el estudio e identificación de cáncer hereditario, por ahora se reportó el avance con el artículo (DOI: 10.1016/j.csbj.2025.07.033) para meduloblastoma.

• PC-2022-320792 “Importancia de entendimiento entre las neoplasias, la inflamación crónica y la remodelación membranal, como estrategia de tratamiento reconstitutivo”

Con el proyecto se encontraron genes a través del algoritmo de redes neuronales para desarrollos de terapia y diagnóstico útiles en medicina preventiva, nutrigenómica y farmacogenómica, reportando un gen y un pseudegen como moléculas con potencial para direccionar fármacos (DOI:10.3390/biomedicines12020395.

Y la interacción del comportamiento genético dependiente de la letalidad de tres funciones: remodelación membranal, respuesta inmune e inflamación crónica

Se ganaron en este año 2025 dos proyectos que se perfilaron para enfocarse al estudio de susceptibilidad genética, los cuales son:

• CBF-2025-I-3609: "Análisis funcional y molecular de genes de inmunidad innata asociados a la respuesta vacunal inducida por BCG en modelos celulares y pacientes con y sin VIH".

Parte de los estudios de este proyecto están enfocados en el desarrollo de nuevos ensayos hacia farmacogenómica con el alcance de vacunología e inmunogenómica

• CBF-2025-I-95: “Caracterización de biomarcadores a parir de exosomas urinarios para comprender el Daño Renal por exposición crónica a metales”.

Parte de los estudios están enfocados en el desarrollo de nuevos ensayos genómicos para comprender el daño renal producto de la exposición crónica a metales para enfocarse hacia la medicina preventiva y farmacogenómica.

• CBF-2025-I-95: “Caracterización de biomarcadores a parir de exosomas urinarios para comprender el Daño Renal por exposición crónica a metales”.
• CF-2023-G-994: “Identificación de biomarcadores personalizados por métodos de aprendizaje profundo aplicable en diagnóstico y seguimiento de meduloblastoma en poblaciones pediátricas”.
• PC-2022-320792: “Importancia de entendimiento entre las neoplasias, la inflamación crónica y la remodelación membranal, como estrategia de tratamiento reconstitutivo”.
• Recursos Autogenerados: Se esta implentando la técnica in chimical para los análisis de fármacos dirigidos hacia la regulación de expresiones de enfermedades crónico degenerativas y sistemas in vitro 3D.

Servicios LAMPER

Dentro de los proyectos se están desarrollando algoritmos y estudios bioinformáticos para utilizar los resultados en nuevos ensayos enfocados en medicina preventiva, nutrigenómica y farmacogenómica como son:

• Evaluación de seguridad y eficacia de nuevas moléculas omicas con potencial terapéutico a través del acoplamiento molecular, cribado virtual y relaciones cuantitativas estructura-actividad (QSAR) para predicción de propiedades farmacológicas y toxicológicas
• Implementación de técnicas de espectrometría y quimioinformática para identificación de moléculas activas
• Implementación metodologías de evaluación para evitar el uso de animales en pruebas de laboratorio, como son las pruebas utilizando la microfluidica en el diseño de dispositivos tipo lab on a chip, órgano and chip y point of care, por lo que nos asociamos con el CIDETEQ y las cuales se utilizan también para la medicina preventiva y famacogenética.

Así como se montan métodos y técnicas para evaluación in Chemical moléculas activas para tratamiento.

Servicios vigentes:

1. Ensayos de farmacogenética.
   • Visitar instituciones que actualmente tengan interés en hacer uso de la farmacogenética para sus  poryectos
2. Interpretación de datos de farmacogenetica.
   • Ofrecer cursos de farmacogenética
   • Integrar un curso optativo en el programa de posgrado vigente en CIATEJ
3. Análisis de ensayos para medicina preventiva
   •  Colaborar con otras instituciones interesadas en los tipos de ensayos para medicina preventiva
   • Ofrecer cursos de farmacogenética
4. Análisis de ensayos de nutrigenómica
   • Evaluar posibles colaboraciones enfocadas a nutrigenómica y aliarsecon investigadores del área de alimetos
   • Ofrecer cursos de farmacogenética

Nuevos servicios:

1. Capacitaciones de uso de programas bioinformáticos y principios de programación basada en redes neuronales
   • Estructuración de cursos de acuerdo a las necesidades del cliente
   • Ofrecimiento en la página de cursos bioinformáticos especializados, presencial o en línea
   • Cursos para posgrado en las universidades
   • Cursos para interesados en el área de gobierno
   • Cursos para interesados en el área de industria
2. Renta de espacio en servidor CIATEJ-BMF
   • Renta del servidor para usuarios del centro
   • Renta del servidor para proyectos
   • Realizar alianzas de uso
3. Diseño de sistemas de terapias y diagnóstico in silico
   • Asesorías a colegas
   • Asesorías a la industria
   • Asesorías al gobierno
   • Asesorías a particulares
4. Asesoría de caracterización fisicoquímica de sistemas y analítico en función a infraestructura disponible
   • Asesorías a colegas
   • Asesorías a la industria
   • Asesorías al gobierno
   • Asesorías a particulares
5. Caracterización molecular de sistemas in silico
   • Asesorías a colegas
   • Asesorías a la industria
   • Asesorías al gobierno
6. Pruebas de sistemas de terapia y diagnóstico in silico, in vitro, in vivo e in chemical
   • Asesorías a colegas
   • Asesorías a la industria
   • Asesorías al gobierno
   • Asesorías a particulares
7. Búsqueda de blancos relevantes para el diseño de farmacos
   • Asesorías a colegas
   • Asesorías a la industria
   • Asesorías al gobierno
8. Diseño racional de fármacos por métodos bioinformáticos
   • Asesorías a colegas
   • Asesorías a la industria
   • Asesorías al gobierno

• Predicción de rSNPs (SNPClinic V.01).
• Diseño de paneles farmacogenómica.
• Genotipificación (ensayos de farmacogenómica, nutrigenómica y medicina preventiva).

¿Cómo funciona SNPClinic?

Software para predecir rSNPs en promores humanos.

Funcionamiento:

• Epigenómica - Coordenadas cromosómicas - 1-184 líneas celulares- 394 factores de transcripción.
• SNPs comunes en la población blanco- 19,000 secuencias de promotor.

Versatilidad:

• Descubrir blancos terapéuticos
• Interpretación genómica
• Farmacogenómica
• Susceptibilidad a enfermedades
• Diseño de ensayos preclínicos/clínicos

Equipos

   1.Purificador de ácidos nucleicos

   Modelo/Marca: MagnaPure2.0 / Roche

   Características especiales: Se pueden extraer 32 muestras simultaneas de RNA o DNA

   Número de inventario:  7554

   Tipos de uso que se le da al equipo: Extracción de DNA y RNA Totales

2.Termociclador de PCR en tiempo real

   Modelo/Marca: Step-One /Applied biosystems (Thermofisher)

   Características especiales:  7 rangos dinámicos, para PCRs de 5 a 100uL

   Número de inventario: 7640

   Tipos de uso que se le da al equipo: Expresión génica absoluta, relativa, genotipificación, ensayos de farmacogenómica

   3.Campana personal para PCR

   Modelo/Marca: Biosan

   Características especiales:  Contiene un sistema patentado de luz interna UV el cual degrada los ácidos nucleicos contaminantes circulantes mientras se trabaja en la campana.

   Número de inventario: 9561

   Tipos de uso que se le da al equipo: Solo para PCR: Cargare ensayos en placas o tiras de tubos para expresión génica absoluta, relativa, genotipificación, ensayos de farmacogenómica.

   4.Campana personal de flujo laminar

   Modelo/Marca: SCR-2A2 Esco

   Número de inventario: 11909

   Características especiales:  flujo laminar horizontal.

   Tipos de uso que se le da al equipo: Extracción de ácidos nucleicos No PCR.

   5.Lector de Elisa

   Modelo/Marca: iMark Biorad

   Número de inventario: 9767

   Características especiales:  Lector de microplacas de 96

   Tipos de uso que se le da al equipo: Cuantificación de péptidos ELISAs

   6.Termociclador de PCR en punto final 

   Modelo/Marca: Tgradient Biometra

   Número de inventario: 7782

   Características especiales: Con placa de 96 y pestaña superior térmica, programación de gradientes.

   Tipos de uso que se le da al equipo: Para amplificación de mRNA (Transcripción reversa)

   7.Lector de arreglos en suspensión con software Xponent 3.1 y Milliplex Analyst 5.1

   Modelo/Marca: Luminex200 MIlipore

   Número de inventario: 7555

   Características especiales:  Lectura de micro arreglos en suspensión 3D con microesferas

   Tipos de uso que se le da al equipo: genotipificación, expresión génica y determinación de hasta 200 analitos simultáneos

   8.Termociclador de PCR en tiempo real

   Modelo/Marca: LightCycler 480 Roche

   Características especiales: Para analizar hasta 96 muestras simultáneamente

   Número de inventario: 7555

   Tipos de uso que se le da al equipo: expresión génica, detección de patógenos.

   9.Centrifuga

   Modelo/Marca: 5430 Esppendorf

   Número de inventario: 12663

   Características especiales: 3 rotores: 1 para microplacas, otro para tiras de 8 tubos y otro para microtubos de 1.5ml

   Tipos de uso que se le da al equipo: Centrifugar placas de PCR previo a las corridas de ensayos o calibraciones de termociclador en tiempo real Stepone

10. Equipo de cómputo:

Servidor HP DL380 Gen9 8SFF CTO Server (6 cores/2.4GHz)

PC-2022-320792

32Gb 2Rx4 PC4-2133P-R, 600GB 6G SAS 10K de DD, DVD-ROM, Licencia Windows

Server Estándar 2012 R2 Academia.

Sin uso.

Servidor de rack Lenovo ThinkSystem SR650

3320792 que incluye: Dos procesadores Intel Xeon Godl 624R 24C a 2.4GHz. Tarjeta de 2 puertos dobles 10Gb Baser T. Tarjeta de 4 puertos 1GbE RJ45 PCLe Ethernet Adapter. 

2 discos de estado sólido de 480Gb SATA Hot Swap (SSD) con capacidad para crear arreglo RAD1. 4 discos duros de 2 TB 7.2K SAS 12 Gb Hot Swap. (HDD) con capacidad para crear RAID  0, 1, 5 y 10. Con capacidad para extenderse a 24 slots. 320 GB en RAM (El servidor puede soportar hasta 7.5 TB en 24 slots de memoria). Fuente de poder 110W + fuente de poder 100W para redundancia.

Colaboradores