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Laboratorio Nacional de Medicina Personalizada Lamper

LAMPER se enfoca en predecir polimorfismos funcionales en regiones regulatorias (promotores) del genoma humano y a diseñar fármacos que tengan mayor eficacia tomando en cuenta las variantes genéticas de los pacientes.

Misión

Predecir polimorfismos funcionales y blancos terapéuticos en el genoma humano mediante software y algoritmos desarrollados por LAMPER, así como optimizar biomoléculas y potenciales fármacos con el objetivo de innovar e impactar en la terapia personalizada en México, en especial lo referente a elicitores e inhibidores de péptidos antimicrobianos (APEs y APIs).

Visión

Ser un Laboratorio Nacional CONACYT con personal altamente calificado para continuar innovando e impactando en la medicina personalizada así como en el diseño y optimización de fármacos en México.

Perfil del Personal

Profesionistas mexicanos y extranjeros de competencia internacional que buscan retos académicos y que estén comprometidos con el desarrollo del LAMPER y de México, que estén buscando la superación profesional y la excelencia en la medicina personalizada basada en estrategias multidisciplinarias. En LAMPER estamos en busca de profesionales sobresalientes en las disciplinas de biología, química, genética, farmacología, informática, biología de sistemas, biología molecular, estadística avanzada y marketing.

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¿Con qué desarrollos cuenta el LAMPER?

Nuestro grupo liderado por CIATEJ, ha desarrollado un software SNPClinic (patente en trámite), para predicción de polimorfismos funcionales/blancos terapéuticos en el genoma humano (Flores Saiffe y cols., sometido). También cuenta con avances en nuevos elicitores/inhibidores de péptidos antimicrobianos inspirados en pequeñas moléculas (Prado Montes de Oca 2009)

  • Servicios
  • Líneas de investigación
  • Temas de investigación
  • Fondos Públicos
  • Publicaciones
  • Solicitudes de Patentes
  • Prensa

    1. Farmacogenómica

  • Diseño de paneles para enfermedades crónico-degenerativas para poblaciones de diferentes orígenes étnicos.
  • Diseño de paneles, según su origen étnico, para enfermedades crónico degenerativos.
  • 2. Predicción de polimorfismos funcionales en promotores humanos

  • Utilizamos un software exclusivo desarrollado por LAMPER (en vías de patente), más sensible y específico que is-rSNP y Regulome Database
  • Podemos analizar cualquier gen (es) o enfermedad (es) humanas, solo enviar nombre (en su defecto tipo) de las líneas celulares relevantes a la enfermedad de interés donde requiere el análisis o agregar al servicio análisis de líneas celulares relevantes para el (las) enfermedad(es).
  • 3. Optimización in silico de pequeñas moléculas (<500 Da) para:

  • Aumentar solubilidad y absorción
  • Eliminar o disminuir toxicidad y/o carcinogenicidad y/o efectos secundarios.
  • Incrementar índice terapéutico.
  • 4. Descubrimiento in silico de nuevos blancos terapéuticos y predicción de polimorfismos funcionales de DNA en regiones regulatorias

    5. Diseño de nuevos paneles de farmacogenética, nutrigenómica y medicina preventiva

    6. Genotipado usando SNP

    7. Estudios para probar la calidad, seguridad y eficacia

    8. Validación de Métodos BioAnalíticos

    9. Estudios Farmacológicos (Farmacocinética, PK y Farmacodinamia, PD)

    10. Fisicoquímicos

  • Mapeo de péptidos
  • Secuenciación del extremo N-terminal
  • Mapeo de puentes disulfuro
  • Mapeo peptídico en condiciones no reductoras
  • Sulfidrilos libres
  • Estructura secundaria
  • Estructura terciaria
  • Presencia y caracterización de N-glicosilación (sitios de glicosilación y composición de glicanos)
  • pI (punto isoeléctrico)
  • Peso molecular
  • Presencia de O-glicosilación
  • Contenido de ácidos siálicos
  • Identificación y contenido de isoformas por enfoque isoeléctrico
  • 11. Biológicos

  • Potencia in vitro
  • Actividad biológica in vitro
  • Ensayo de unión a receptor
  • Farmacodinamia in vivo
  • Farmacocinética in vivo
  • 12. Toxicológicos

  • Toxicocinética dosis repetida en animales sanos (45 días)
  • Inocuidad
  • 13. Al Proceso

  • Remoción viral

    1. Desarrollo y validación de pruebas de diagnóstico molecular.

    1. Desarrollo de nuevas versiones de SNPClinic (patente en proceso), software desarrollado por LAMPER, el cual predice polimorfismos funcionales en regiones promotoras de genes humanos relevantes en enfermedades y específicos de tejido/línea celular (Flores Saiffe y cols., sometido).

    2. Desarrollo de paneles para enfermedades crónico degenerativas utilizando la herramienta SNPClinic (patente en proceso) en poblaciones según su origen étnico.

    3. Diseño y optimización de elicitores (Prado Montes de Oca, 2009; 2013; Cruz Díaz y cols., 2015, 3 patentes en proceso) e inhibidores de péptidos antimicrobianos (Prado Montes de Oca, 2013; 2014, 1 patente en proceso).

    4. Caracterización molecular (varioma, transcriptoma y proteoma) del VIH/SIDA, psoriasis, diabetes, obesidad, cáncer y enfermedades neurologicas.

  • 2015 Creación del Laboratorio de Medicina Personalizada del Centro de Investigación y Asistencia en Tecnología y Diseño del Estado de Jalisco A.C. (recursos fiscales CIATEJ)
  • 2015 Red de Biotecnología Aplicada a la Salud (recursos fiscales CIATEJ, apoyo parcial).
  • 2015 Tecnologías de la Información y Comunicaciones (Recursos fiscales CIATEJ, apoyo parcial)
  • 2015-2018 Evaluación de parámetros genéticos y epigenéticos para predicción de polimorfismos funcionales en promotores proximales relevantes a tuberculosis y VIH/SIDA. Fondo Sectorial de Ciencia Básica SEP-CONACYT (CB-2014-01-222618).
  • 2014 Proceso para obtener una molécula que sirve como un elicitor de péptidos antimicrobianos (APEs). Propiedad intelectual (PROPIN), Consejo Estatal de Ciencia y Tecnología (COECYTJAL).
  • 2012-2015 Evaluación de polimorfismos en genes de péptidos antimicrobianos humanos como predictores de su expresión, características clínicas y susceptibilidad a tuberculosis. Fondos Mixtos del Gobierno del Estado de Aguascalientes-CONACYT (AGS-2010-C02-143938).
  • 2011-2014 Evaluación de elicitores químicos y físicos en la expresión de catelicidina LL-37 y β-defensinas humanas” perteneciente al Fondo Sectorial de Ciencia Básica SEP-CONACYT (CB-2008-01-10581).

Cruz Díaz LA, Flores Miramontes MG, Chávez Hurtado P, Allen K, Gonzalez Ávila M, Prado Montes de Oca E. Ascorbic acid, ultraviolet C rays, and glucose but not hyperthermia are elicitors of human β-defensin 1 mRNA in normal keratinocytes. Biomed Res Int. 2015;2015:714580. doi: 10.1155/2015/714580. Epub 2015 Mar 1. PubMed PMID: 25815330; PubMed Central PMCID: PMC4359827.

Estrada-Aguirre JA, Osuna-Ramírez I, Prado Montes de Oca E, Ochoa-Ramirez LA, Ramirez M, Magallon-Zazueta LG, Gonzalez-Beltran MS, Cazarez-Salazar SG, Rangel-Villalobos H, Velarde-Felix JS. DEFB1 5'UTR polymorphisms modulate the risk of HIV-1 infection in Mexican women. Curr HIV Res. 2014;12(3):220-6. PubMed PMID: 25001249.

López Campos GN, Velarde Félix JS, Sandoval Ramírez L, Cázares Salazar S, Corona Nakamura AL, Amaya Tapia G, Prado Montes de Oca E. Polymorphism in cathelicidin gene (CAMP) that alters Hypoxia-inducible factor (HIF-1α::ARNT) binding is not associated with tuberculosis. Int J Immunogenet. 2014 Feb;41(1):54-62. doi: 10.1111/iji.12080. Epub 2013 Aug 16. PubMed PMID: 23953711.

Prado Montes de Oca E, Li W. Human β-defensin 1 (DEFB1) allele and genotype frequencies probably impact on ethnic susceptibility to atopic dermatitis. Int J Dermatol. 2013 Jan;52(1):115-7. doi: 10.1111/j.1365-4632.2010.04853.x. PubMed PMID: 23278620.

Prado Montes de Oca E. Antimicrobial peptide elicitors: new hope for the post-antibiotic era. Innate Immun. 2013 Jun;19(3):227-41. doi: 10.1177/1753425912460708. Epub 2012 Nov 16. Review. PubMed PMID: 23160387.

López Ávalos GG, Prado Montes de Oca E. Classic and new diagnostic approaches to childhood tuberculosis. J Trop Med. 2012;2012:818219. doi: 10.1155/2012/818219. Epub 2012 Mar 12. PubMed PMID: 22529869; PubMed Central PMCID: PMC3317187.

Prado Montes de Oca E. Human polymorphisms as clinical predictors in leprosy. J Trop Med. 2011;2011:923943. doi: 10.1155/2011/923943. Epub 2011 Dec 18. PubMed PMID: 22220182; PubMed Central PMCID: PMC3246779.

Prado Montes de Oca E. Human beta-defensin 1: a restless warrior against allergies, infections and cancer. Int J Biochem Cell Biol. 2010 Jun;42(6):800-4. doi: 10.1016/j.biocel.2010.01.021. Epub 2010 Jan 25. Review. PubMed PMID: 20100591.

Prado Montes de Oca E. Antimicrobial peptide elicitors: a potential strategy against infections. Gac Med Mex. 2009 May-Jun;145(3):241-3. PubMed PMID: 19685832.

*Para opciones de colaboración con LAMPER contactar al Dr. Ernesto Prado (eprado@ciatej.mx)

Fernández-Grijalva, A. et al. Alpha 2HS-glycoprotein, a tumor-associated antigen (TAA) detected in Mexican patients with early-stage breast cancer. Journal of Proteomics 112, 301-312.

Flores-Saiffe Farías A, Herrera López EJ, Moreno Vázquez CJ, Li W, Prado Montes de Oca E. Predicting functional regulatory SNPs in the human antimicrobial peptide genes DEFB1 and CAMP in tuberculosis and HIV/AIDS. Comp Biol Chem 59 PtA:117-25

  • Prado Montes de Oca E. 2014. The potential of antimicrobial peptide inhibitors (APIs) and elicitors(APEs) in leprosy treatment. In book: leprosy: Epidemiology Treatment Strategies and Current Challenges in Research, Edition: First, Chapter: The potential of antimicrobial peptide inhibitors (APIs) and elicitors (APEs) in leprosy treatment, Publisher: Nova Publishers, Editors: Roger S. Koop, pp.71-91
  • Pelallo-Martínez NA, Prado Montes de Oca E, Santacruz-Esparza E, Gaspar-Ramírez O. Expression of genes associated with hematological malignances in children exposed to benzene. Toxicol Lett 259S (2016) S73-S247.
  • Software to predict functional polymorphisms in the human genome (sometida a la oficina de patentes de Estados Unidos).
  • Pharmacogenomic assays for cancer, type II diabetes mellitus, hypertension and neurological diseases (sometida a la oficina de patentes de Estados Unidos).

Software to predict functional polymorphisms in the human genome (en proceso).

MX/a/2015/002594 Lámpara de UVA y UVC para el tratamiento de enfermedades infecciosas y cáncer de piel.

PCT/MX 2014/000161 Proceso para obtener una molécula que sirve como elicitor de péptidos antimicrobianos.

MX/a/2014/004496 Proceso para obtener una molécula que sirve como inhibidor de péptidos antimicrobianos.

MX/a/2013/012160 Proceso para obtener una molécula que sirve como elicitor de péptidos antimicrobianos.

Investigadores/as

Ventajas de trabajar con nosotros

  • Resultados de acuerdo con las guías actualizadas de Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC®, USA)
  • Certificación ISO 9001:2008 en proceso
  • Software propio con la más alta especificidad jamás (84,6%) en la predicción de SNPs funcionales (Flores Saiffe al 2015)
  • Enfocado en la (s) línea (s) celular (es), enfermedad (s), origen (s) étnico (s) y frecuencias alélicas de la (s) población
  • Una forma asequible y más rápida de elegir variantes genéticas para continuar los estudios preclínicos / de investigación
  • 14 años de experiencia en genotipado por PCR en Tiempo Real

Estrategia Técnica

  • Predicción in silico de variantes genéticas funcionales empleando nuestro software SNPClinic v.1.0 (patente en proceso)
  • Diseño y optimización de ensayos de genotipado por PCR-tiempo real

Patentes e Innovaciones

  • Proceso para simulación de tracto digestivo humano.
  • Sistema mecánico y neumático para transferencia de fluido entre dos bioreactores.
  • Sistema automatizado para la simulación del tracto digestivo humano.
  • Bioinformatic system and method for candidate regulatory single nucleotide polymorphisms selection.

Proyectos

  • Creation of a Preclinical Research Laboratory of Pharmaceutical Products in Jalisco”. FOMIX-JAL-250508.
  • “Establishment of the Personalized Medicine National Laboratory (LAMPER)”, CONACYT´s Special Funds LN-271627.

Instituciones colaboradoras

Contacto:
Dr. Ernesto Prado Montes de Oca
eprado@ciatej.mx
+52 (01) 3345 5200 Ext. 1675

Contacto
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