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Dr. Ernesto Prado Montes de Oca

Dr. Ernesto Prado Montes de Oca

Director Lamper

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Perfil del Personal

Profesionistas de competencia internacional que buscan retos académicos y que estén comprometidos con el desarrollo del LAMPER y de México, que estén buscando la superación profesional y la excelencia en la medicina personalizada basada en estrategias multidisciplinarias. En LAMPER recibimos profesionales sobresalientes en las disciplinas de biología, química, genética, informática, biología de sistemas, biología molecular, mercadotecnia, negocios internacionales en las etapas de servicio social, prácticas profesionales, tesis de pre y posgrado, posdoctorados nacionales, cátedras CONACYT e investigadores en estancias sabáticas.

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LAMPER es un Laboratorio Nacional CONACYT desde 2016. Nos enfocamos en desarrollar nuevas versiones del software SNPClinic el cual aplicamos para predecir Polimorfismos de un Solo Nucleótido regulatorios (rSNPs, es decir, aquellas variantes genéticas que impactan en la expresión de los genes) con 85% de especificidad. Estas predicciones las aplicamos para diseñar y validar paneles de farmacogenómica, medicina preventiva (susceptibilidad a enfermedades), diagnósticos acompañantes y descubrir blancos terapéuticos que servirán para la invención y desarrollo de futuros fármacos más eficientes y seguros (que provoquen menos efectos secundarios en el paciente) así como sus diagnósticos acompañantes.

Misión

Ser un referente nacional en medicina personalizada en cuatro ejes estratégicos:

  1.  Investigación de frontera
  2.  Formación de recursos humanos de alto nivel
  3.  Servicios altamente especializados
  4. Vinculación con gobierno, industrias, academia y sociedad

 

Visión

• Un tamiz genético para cada mexicano.• Descubrir los SNPs regulatorios de las enfermedades más comunes en México.

Infraestructura y laboratorios

¿Con qué desarrollos cuenta el LAMPER?

  • Nuestro grupo ha desarrollado un software, SNPClinic, que sirve para descubrir variantes genéticas que causan enfermedades y blancos terapéuticos en el genoma humano.

  • También cuenta con nuevas moléculas diseñadas en México que no existen en la naturaleza llamadas elicitores e inhibidores de péptidos antimicrobianos (APEs y APIs, por sus siglas en inglés, en vías de patente) con potencial aplicación en el tratamiento de cáncer, enfermedades infecciosas y autoinmunes como psoriasis.

  • Diseñamos 44 ensayos de farmacogenómica que sirven para seleccionar un medicamento y la dosis sugerida para tratar de manera más efectiva y con menos efectos secundarios la hipertensión, hipercolesterolemia, diabetes mellitus tipo 2, infarto al miocardio, β-talasemia, hemofilia, diversos tipos de cáncer, enfermedades neurológicas y VIH/SIDA.

Servicios


A EMPRESAS, LABORATORIOS DE INVESTIGACIÓN Y UNIVERSIDADES:

  • SC1 Predicción de variantes genéticas (rSNPs, específicos de línea celular, enfermedad y grupo étnico/paciente) involucradas en enfermedades. Con aplicaciones en diseño de fármacos, medicina preventiva, farmacogenómica, estudios de asociación genética y estudios clínicos.

  • SC2 Diseño de nuevos ensayos y paneles de farmacogenética, nutrigenómica y medicina preventiva (susceptibilidad a enfermedades).

  • FG1 Genotipificación de los siguientes ensayos de farmacogenética (diseño exclusivo LAMPER en vías de patente) 

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Líneas de investigación


Desarrollo y validación de pruebas de diagnóstico molecular.

Temas de investigación


  1. Desarrollo de nuevas versiones del SNPClinic, software que simula in silico la expresión de genes humanos.
  2. Proponer las causas moleculares de las enfermedades humanas debidas a una alteración de la expresión de los genes (niveles mRNA) causadas por SNPs regulatorios (rSNPs).

Fondos Públicos


  • 2018 Laboratorio Nacional de Medicina Personalizada (consolidación) LN-293405 Fondos especiales CONACYT.
  • 2017 Implementación y actualización de sistemas de gestión de la calidad, bajo norma ISO, en los Laboratorios Nacionales CONACYT.

  • 2016 Laboratorio Nacional de Medicina Personalizada (establecimiento) LN-271627 Fondos especiales CONACYT.

Publicaciones


Cruz Díaz LA, Flores Miramontes MG, Chávez Hurtado P, Allen K, Gonzalez Ávila M, Prado Montes de Oca E. Ascorbic acid, ultraviolet C rays, and glucose but not hyperthermia are elicitors of human β-defensin 1 mRNA in normal keratinocytes. Biomed Res Int. 2015;2015:714580. doi: 10.1155/2015/714580. Epub 2015 Mar 1. PubMed PMID: 25815330; PubMed Central PMCID: PMC4359827.

Estrada-Aguirre JA, Osuna-Ramírez I, Prado Montes de Oca E, Ochoa-Ramirez LA, Ramirez M, Magallon-Zazueta LG, Gonzalez-Beltran MS, Cazarez-Salazar SG, Rangel-Villalobos H, Velarde-Felix JS. DEFB1 5'UTR polymorphisms modulate the risk of HIV-1 infection in Mexican women. Curr HIV Res. 2014;12(3):220-6. PubMed PMID: 25001249.

Gutiérrez-Amavizca BE, Gal A, Ortíz-Orozco R, Orth U, Prado Montes De Oca E, Gutiérrez-Amavizca JP, Figuera LE. Mutational analysis of the GLA gene in Mexican families with Fabry disease. J Genet. 2017 Mar;96(1):161-164. PubMed PMID: 28360401. 

López Campos GN, Velarde Félix JS, Sandoval Ramírez L, Cázares Salazar S, Corona Nakamura AL, Amaya Tapia G, Prado Montes de Oca E. Polymorphism in cathelicidin gene (CAMP) that alters Hypoxia-inducible factor (HIF-1α::ARNT) binding is not associated with tuberculosis. Int J Immunogenet. 2014 Feb;41(1):54-62. doi: 10.1111/iji.12080. Epub 2013 Aug 16. PubMed PMID: 23953711.

Ochoa-Ramírez LA, Becerra-Loaiza DS, Díaz-Camacho SP, Muñoz-Estrada VF,  Ríos-Burgueño ER, Prado-Montes de Oca E, Rangel-Villalobos H, Velarde-Félix JS. Association of human beta-defensin 1 gene polymorphisms with nonsegmental vitiligo. Clin Exp Dermatol. 2018  doi: 10.1111/ced.13697. 

Prado Montes de Oca E. 2017. Antimicrobial Peptide Elicitors (APEs) and inhibitors (APIs): challenges and opportunities in personalized medicine. Nov Appro Drug Des Dev 2 (1): 555580. 

Prado Montes de Oca E, Li W. Human β-defensin 1 (DEFB1) allele and genotype frequencies probably impact on ethnic susceptibility to atopic dermatitis. Int J Dermatol. 2013 Jan;52(1):115-7. doi: 10.1111/j.1365-4632.2010.04853.x. PubMed PMID: 23278620.

Prado Montes de Oca E. Antimicrobial peptide elicitors: new hope for the post-antibiotic era. Innate Immun. 2013 Jun;19(3):227-41. doi: 10.1177/1753425912460708. Epub 2012 Nov 16. Review. PubMed PMID: 23160387.

López Ávalos GG, Prado Montes de Oca E. Classic and new diagnostic approaches to childhood tuberculosis. J Trop Med. 2012;2012:818219. doi: 10.1155/2012/818219. Epub 2012 Mar 12. PubMed PMID: 22529869; PubMed Central PMCID: PMC3317187.

Prado Montes de Oca E. Human polymorphisms as clinical predictors in leprosy. J Trop Med. 2011;2011:923943. doi: 10.1155/2011/923943. Epub 2011 Dec 18. PubMed PMID: 22220182; PubMed Central PMCID: PMC3246779.

Prado Montes de Oca E. Human beta-defensin 1: a restless warrior against allergies, infections and cancer. Int J Biochem Cell Biol. 2010 Jun;42(6):800-4. doi: 10.1016/j.biocel.2010.01.021. Epub 2010 Jan 25. Review. PubMed PMID: 20100591.

Prado Montes de Oca E. Antimicrobial peptide elicitors: a potential strategy against infections. Gac Med Mex. 2009 May-Jun;145(3):241-3. PubMed PMID: 19685832.

Fernández-Grijalva, A. et al. Alpha 2HS-glycoprotein, a tumor-associated antigen (TAA) detected in Mexican patients with early-stage breast cancer. Journal of Proteomics 112, 301-312.

Flores-Saiffe Farías A, Herrera López EJ, Moreno Vázquez CJ, Li W, Prado Montes de Oca E. Predicting functional regulatory SNPs in the human antimicrobial peptide genes DEFB1 and CAMP in tuberculosis and HIV/AIDS. Comp Biol Chem 59 PtA:117-25.

Prado Montes de Oca E. 2014. The potential of antimicrobial peptide inhibitors (APIs) and elicitors(APEs) in leprosy treatment. In book: leprosy: Epidemiology Treatment Strategies and Current Challenges in Research, Edition: First, Chapter: The potential of antimicrobial peptide inhibitors (APIs) and elicitors (APEs) in leprosy treatment, Publisher: Nova Publishers, Editors: Roger S. Koop, pp.71-91.

Pelallo-Martínez NA, Prado Montes de Oca E, Santacruz-Esparza E, Gaspar-Ramírez O. Expression of genes associated with hematological malignances in children exposed to benzene. Toxicol Lett 259S (2016) S73-S247.

Solicitudes de Patentes


  • 62/412,140 (USA) 2016  Bioinformatic system and method for candidate regulatory single nucleotide polymorphisms selection 
  • MX/a/2015/002594 Lámpara de UVA y UVC para el tratamiento de enfermedades infecciosas y cáncer de piel.

Videos LAMPER


Proyectos


  • 2018 Laboratorio Nacional de Medicina Personalizada (consolidación) LN-293405 Fondos especiales CONACYT.

Patentes e Innovaciones


  • PCT/MX 2014/000161 Proceso para obtener una molécula que sirve como elicitor de péptidos antimicrobianos.
  • MX/a/2013/012160 Proceso para obtener una molécula que sirve como elicitor de péptidos antimicrobianos.
  • MX/a/2014/004496 Proceso para obtener una molécula que sirve como inhibidor de péptidos antimicrobianos.

Estrategia Técnica


  • Predicción in silico de variantes genéticas funcionales empleando nuestro software SNPClinic v.1.0 (patente en proceso)
  • Diseño y optimización de ensayos de genotipado por PCR-tiempo real

Ventajas de trabajar con nosotros


  • Resultados de acuerdo con las guías actualizadas de Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC®, USA)
  • Certificación ISO 9001:2008 otorgada en septiembre 2017 para servicios especializados LAMPER y renovación para formación de recursos humanos e investigación (ISO 9001:2015 por otorgarse). Preparando certificación ISO15189.
  • El SNPClinic es un software propio con la más alta especificidad a nivel mundial (84,6%) en la predicción de SNPs regulatorios.
  • Enfocado en la (s) línea (s) celular (es), enfermedad (s), origen (s) étnico (s) y frecuencias alélicas de la (s) población.
  • Una forma asequible y más rápida de elegir variantes genéticas para continuar los estudios preclínicos / de investigación.
  • 14 años de experiencia en genotipado por PCR en Tiempo Real.

Personal


Laura Patricia Prado Aguilar

Laura Patricia Prado Aguilar

Especialidad:

Ingeniería en Biotecnología.Universidad Politécnica de Sinaloa

Adscripción:

Incorporación temprana a la Investigación

Fernando Arellano Chávez

Fernando Arellano Chávez

Especialidad:

Universidad Politécnica de Pénjamo

Adscripción:

Incorporación temprana a la Investigación

Rafael Vázquez Solórzano

Rafael Vázquez Solórzano

Especialidad:

Ingeniería en Sistemas Biológicos del Centro Universitario del Sur

Adscripción:

Incorporación temprana a la Investigación

Alondra García Ramírez

Alondra García Ramírez

Especialidad:

Médico Cirujano Partero del Centro Universitario del Sur

Adscripción:

Incorporación temprana a la Investigación

José Ángel García Valle

José Ángel García Valle

Especialidad:

Licenciatura en Biología del Centro Universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias

Adscripción:

Prácticas Profesionales

Emanuel de la Cruz

Emanuel de la Cruz

Especialidad:

Licenciatura en Nutrición del Centro Universitario del Sur

Adscripción:

Servicio Social

Dr. Ernesto Prado Montes de Oca

Dr. Ernesto Prado Montes de Oca

Especialidad:

Maestría y Doctorado en Genética Humana

Puesto:

Responsable del LAMPER, Investigador Titular A, SNI I

Funciones:

Predicción de polimorfismos funcionales, optimización in silico de moléculas, diseño de sondas y primers EPIC

E-mail: eprado@ciatej.mx Experiencia Académica
M.C. Andrea Virginia Ruíz Ramírez

M.C. Andrea Virginia Ruíz Ramírez

Especialidad:

Maestra en Ciencias

Adscripción:

Estudiante del Doctorado en Genética Humana

Funciones:

Búsqueda de rSNPs y correlación genotipo-fenotipo en enfermedad de Fabry

E-mail: and66@hotmail.com
Sahmar Sedano Armenta

Sahmar Sedano Armenta

Especialidad:

Lic. Químico Farmacobiólogo (Farmacogenómica)

Puesto:

Auxiliar de investigación. Prestador de Servicio Social.

Funciones:

Análisis in vitro de polimorfismos putativamente funcionales.

E-mail: ssedano_pg@ciatej.mx
Aurora Ramos Rodríguez

Aurora Ramos Rodríguez

Adscripción:

Estudiantes de la Maestría en Salud Pública del Centro Universitario del Sur

Erika Janine Herrera Oliva

Erika Janine Herrera Oliva

Adscripción:

Estudiante de la Maestría en Salud Pública del Centro Universitario del Sur

Colaboradores


Dr. Juan Carlos Mateos Díaz

Dr. Juan Carlos Mateos Díaz

Especialidad:

Biocatálisis, síntesis química y enzimática

Puesto:

Investigador Titular C

Adscripción:

Biotecnología Industrial. CIATEJ, Unidad Zapopan

Experiencia Académica
M.I.P. Héctor Ibarra Gómez

M.I.P. Héctor Ibarra Gómez

Especialidad:

Ingeniería industrial (productividad y sistemas de calidad)

Puesto:

Coordinador de Tecnologías de Información y Comunicación (TICs)

Adscripción:

TIC´s. CIATEJ, Unidad Guadalajara

Dr. Octavio Gaspar Ramírez

Dr. Octavio Gaspar Ramírez

Especialidad:

Leucemias infantiles

Puesto:

Investigador titular A

Adscripción:

Biotecnología Industrial, Unidad Noreste, CIATEJ AC, CONACYT, Monterrey, Nuevo León

Dra. María Luisa Pita López

Dra. María Luisa Pita López

Especialidad:

Inmunología de las enfermedades crónico-degenerativas

Puesto:

Profesora e investigadora titular B

Adscripción:

Centro de Investigación en Biología Molecular de las enfermedades crónico-degenerativas (CIBIMEC), CUSUR, Universidad de Guadalajara, Ciudad Guzmán, Jalisco.

Experiencia Académica
Dr. Jesús Salvador Velarde Félix

Dr. Jesús Salvador Velarde Félix

Especialidad:

Inmunogenética de tuberculosis y VIH/SIDA

Puesto:

Investigador titular

Adscripción:

Centro de Medicina Genómica, Hospital General de Culiacan, Secretaría de Salud Sinaloa (SSS).

Experiencia Académica
Dr. Luis Figuera

Dr. Luis Figuera

Especialidad:

Genética clínica y enfermedades lisosomales

Puesto:

Investigador titular

Adscripción:

División de genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social (CIBO-IMSS).

Experiencia Académica
Dra. Teresa Magaña

Dra. Teresa Magaña

Especialidad:

Análisis poblacional y de haplotipos (hemoglobinopatías)

Puesto:

Investigador titular

Adscripción:

División de genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social (CIBO-IMSS).

Experiencia Académica
Dr. Kirk Allen

Dr. Kirk Allen

Especialidad:

Estadística Avanzada, programación R y SAS

Puesto:

Investigador asociado

Adscripción:

Asesor independiente, ex-miembro de la Universidad de Lancaster, Reino Unido.

Experiencia Académica
Dr. Wentian Li

Dr. Wentian Li

Especialidad:

Genética médica, estadística, genómica, bioinformática

Puesto:

Investigador asociado

Adscripción:

The Robert S. Boas Center for Human Genetics and Genomics, Feinstein Institute for Medical Research, Manhasset Nueva York, EU

Experiencia Académica
Dr. Michael Zasloff

Dr. Michael Zasloff

Especialidad:

Inmunidad innata e inflamación

Puesto:

Investigador titular

Adscripción:

Transplant Institute, Georgetown University, Washington, EU

Experiencia Académica
Dr. Gudmundur Gudmundsson

Dr. Gudmundur Gudmundsson

Especialidad:

Inmunidad innata e inflamación, elicitores de catelicidina LL-37

Puesto:

Investigador titular

Adscripción:

University of Iceland, Reykjavik, Islandia

Experiencia Académica
Dr. Ulvi Kahraman Gursoy

Dr. Ulvi Kahraman Gursoy

Especialidad:

Marcadores de enfermedades orales (periodontitis)

Puesto:

Profesor asociado

Adscripción:

Institute of Dentistry, University of Turku, Finlandia

Experiencia Académica
Dr. Donald Davidson

Dr. Donald Davidson

Especialidad:

Rol de la catelicidina contra las enfermedades infecciosas (virales)

Puesto:

Investigador titular

Adscripción:

MRC Centre for Inflammation Research, University of Edindurgh, United Kingdom

Experiencia Académica
Dr. Abel Gutiérrez Ortega

Dr. Abel Gutiérrez Ortega

Especialidad:

Vectores de clonación y transformación celular (validación de polimorfismos putativamente funcionales)

Puesto:

Investigador titular B

Adscripción:

Biotecnología Médica y Farmacéutica, Unidad Guadalajara, CIATEJ A.C., CONACYT

Dr. Jorge Bravo Madrigal

Dr. Jorge Bravo Madrigal

Especialidad:

Ensayos antimicrobianos (microbiología)

Puesto:

Investigador asociado C

Adscripción:

Biotecnología Médica y Farmacéutica, Unidad Guadalajara, CIATEJ, CONACYT

Dr. Rodolfo Hernández Gutiérrez

Dr. Rodolfo Hernández Gutiérrez

Especialidad:

Proteómica

Adscripción:

Biotecnología Médica y Farmacéutica, Unidad Guadalajara, CIATEJ, CONACYT

Experiencia Académica
Dr. Ángel Hilario Álvarez Herrera

Dr. Ángel Hilario Álvarez Herrera

Especialidad:

Tuberculosis

Puesto:

Biotecnología Médica y Farmacéutica, Unidad Guadalajara, CIATEJ, CONACYT

Instituciones colaboradoras y asociadas.


Contacto:

Dr. Ernesto Prado Montes de Oca

+52 (01) 3345 5200 Ext. 1675

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