Dr. Ernesto Prado Montes de Oca

Director Lamper

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Perfil del Personal

Profesionistas de competencia internacional que buscan retos académicos y que estén comprometidos con el desarrollo del LAMPER y de México, que estén buscando la superación profesional y la excelencia en la medicina personalizada basada en estrategias multidisciplinarias. En LAMPER recibimos profesionales sobresalientes en las disciplinas de biología, química, genética, informática, biología de sistemas, biología molecular, mercadotecnia, negocios internacionales en las etapas de servicio social, prácticas profesionales, tesis de pre y posgrado, posdoctorados nacionales, cátedras CONACYT e investigadores en estancias sabáticas.

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LAMPER es un Laboratorio Nacional CONACYT desde 2016. Nos enfocamos en desarrollar nuevas versiones del software SNPClinic el cual aplicamos para predecir Polimorfismos de un Solo Nucleótido regulatorios (rSNPs, es decir, aquellas variantes genéticas que impactan en la expresión de los genes) con 85% de especificidad. Estas predicciones las aplicamos para diseñar y validar paneles de farmacogenómica, medicina preventiva (susceptibilidad a enfermedades), diagnósticos acompañantes y descubrir blancos terapéuticos que servirán para la invención y desarrollo de futuros fármacos más eficientes y seguros (que provoquen menos efectos secundarios en el paciente) así como sus diagnósticos acompañantes.

Misión

Ser un referente nacional en medicina personalizada en cuatro ejes estratégicos:

Investigación de frontera
Formación de recursos humanos de alto nivel
Servicios altamente especializados
Vinculación con gobierno, industrias, academia y sociedad

Visión

• Un tamiz genético para cada mexicano.• Descubrir los SNPs regulatorios de las enfermedades más comunes en México.

Infraestructura y laboratorios

¿Con qué desarrollos cuenta el LAMPER?

Nuestro grupo ha desarrollado un software, SNPClinic, que sirve para descubrir variantes genéticas que causan enfermedades y blancos terapéuticos en el genoma humano.

También cuenta con nuevas moléculas diseñadas en México que no existen en la naturaleza llamadas elicitores e inhibidores de péptidos antimicrobianos (APEs y APIs, por sus siglas en inglés, en vías de patente) con potencial aplicación en el tratamiento de cáncer, enfermedades infecciosas y autoinmunes como psoriasis.
Diseñamos 44 ensayos de farmacogenómica que sirven para seleccionar un medicamento y la dosis sugerida para tratar de manera más efectiva y con menos efectos secundarios la hipertensión, hipercolesterolemia, diabetes mellitus tipo 2, infarto al miocardio, β-talasemia, hemofilia, diversos tipos de cáncer, enfermedades neurológicas y VIH/SIDA.

Líneas de investigación

Desarrollo y validación de pruebas de diagnóstico molecular.

Temas de investigación

Desarrollo de nuevas versiones del SNPClinic, software que simula in silico la expresión de genes humanos.
Proponer las causas moleculares de las enfermedades humanas debidas a una alteración de la expresión de los genes (niveles mRNA) causadas por SNPs regulatorios (rSNPs).

Fondos Públicos

2018 Laboratorio Nacional de Medicina Personalizada (consolidación) LN-293405 Fondos especiales CONACYT.
2017 Implementación y actualización de sistemas de gestión de la calidad, bajo norma ISO, en los Laboratorios Nacionales CONACYT.
2016 Laboratorio Nacional de Medicina Personalizada (establecimiento) LN-271627 Fondos especiales CONACYT.

Publicaciones

https://doi.org/10.3389/fviro.2022.849349.

Therapeutic Potential of Long Non-Coding RNAs of HIV-1, SARS-CoV-2, and Endogenous Retroviruses. Ruiz Ramírez AV, Prado Montes de Oca E. 2022. Front Virol. 2022.

Prediction of Regulatory SNPs in Putative Minor Genes of the Neuro-Cardiovascular Variant in Fabry Reveals Insights into Autophagy/Apoptosis and Fibrosis.

Ruiz Ramírez AV, Prado Montes de Oca E, Figuera LE. Biology (Basel). 2022 ;11(9):1287. doi: 10.3390/biology11091287. PMID: 36138766.

Impact of polygenic risk communication: an observational mobile application-based coronary artery disease study.

Muse ED, Chen SF, Liu S, Fernandez B, Schrader B, Molparia B, León AN, Lee R, Pubbi N, Mejia N, Ren C, El-Kalliny A, Prado Montes de Oca E, Aguilar H, Ghoshal A, Dias R, Evans D, Chen KY, Zhang Y, Wineinger NE, Spencer EG, Topol EJ, Torkamani A. NPJ Digit Med. 2022 Mar 11;5(1):30. doi: 10.1038/s41746-022-00578-w. PMID: 35277577.

β-defensin 1 Gene Polymorphisms are Associated with Kidney Disease in Northwestern Mexicans with Type 2 Diabetes.

Ochoa-Ramirez LA, Rodriguez Millan J, Mendoza Vázquez LF, Díaz-Camacho SP, Verdugo Quiñonez SI, Rojas-Herrera DC, López Castro M, Prado Montes de Oca E, Velarde-Felix JS. Immunol Invest. 2022 Jul;51(5):1398-1406. doi: 10.1080/08820139.2021.1948564. PMID: 34251960

Introduction to the EQIPD quality system.

Bespalov A, Bernard R, Gilis A, Gerlach B, Guillén J, Castagné V, Lefevre IA, Ducrey F, Monk L, Bongiovanni S, Altevogt B, Arroyo-Araujo M, Bikovski L, de Bruin N, Castaños-Vélez E, Dityatev A, Emmerich CH, Fares R, Ferland-Beckham C, Froger-Colléaux C, Gailus-Durner V, Hölter SM, Hofmann MC, Kabitzke P, Kas MJ, Kurreck C, Moser P, Pietraszek M, Popik P, Potschka H, Prado Montes de Oca E, Restivo L, Riedel G, Ritskes-Hoitinga M, Samardzic J, Schunn M, Stöger C, Voikar V, Vollert J, Wever KE, Wuyts K, MacLeod MR, Dirnagl U, Steckler T. Elife. 2021;10:e63294. doi: 10.7554/eLife.63294. PMID: 34028353.

Predicted regulatory SNPs reveal potential drug targets and novel companion diagnostics in psoriasis.

Ruiz Ramírez AV, Flores-Saiffe Farías A, Chávez Álvarez RDC, Prado Montes de Oca E, J Transl Autoimmun. 2021 ;4:100096. doi: 10.1016/j.jtauto.2021.100096. PMID: 33898962.

Predicting Pathogenicity of CDH1 Gene Variants in Patients with Early-onset Diffuse Gastric Cancer from Western Mexico.

García-Ruvalcaba A, Rizo de la Torre LDC, Magaña-Torres MT, Prado Montes de Oca E, Ruiz-Ramírez AV, Rangel-Villalobos H, Aguilar-Velázquez JA, García-Muro AM, Sánchez-López JY. Rev Invest Clin. 2021 doi: 10.24875/RIC.20000470. PMID: 33465060.

Association of P10L Polymorphism in Melanopsin Gene with Chronic Insomnia in Mexicans.

Gutiérrez-Amavizca BE, Prado Montes de Oca E, Gutiérrez-Amavizca JP, Castro OD, Ruíz-Marquez CH, Perez Conde-Andreu K, Pérez Calderón R, Aguirre Ramírez M, Pérez-León JA. Int J Environ Res Public Health. 2021 Jan 12;18(2):571. doi: 10.3390/ijerph18020571. PMID: 33445464.

Regulatory SNP rs5743417 impairs constitutive expression of human β-defensin 1 and has high frequency in Africans and Afro-Americans.

Cruz Díaz LA, Gutiérrez Ortega A, Chávez Álvarez RDC, Velarde Félix JS, Prado Montes de Oca E. Int J Immunogenet. 2020 Aug;47(4):332-341. doi: 10.1111/iji.12475. PMID: 31994826.

Human β-defensin 1 update: Potential clinical applications of the restless warrior.

Álvarez ÁH, Martínez Velázquez M, Prado Montes de Oca E. Int J Biochem Cell Biol. 2018 Nov;104:133-137. doi: 10.1016/j.biocel.2018.09.007. Epub 2018 Sep 17. PMID: 30236992

Cruz Díaz LA, Flores Miramontes MG, Chávez Hurtado P, Allen K, Gonzalez Ávila M, Prado Montes de Oca E. Ascorbic acid, ultraviolet C rays, and glucose but not hyperthermia are elicitors of human β-defensin 1 mRNA in normal keratinocytes. Biomed Res Int. 2015;2015:714580. doi: 10.1155/2015/714580. Epub 2015 Mar 1. PubMed PMID: 25815330; PubMed Central PMCID: PMC4359827.

Estrada-Aguirre JA, Osuna-Ramírez I, Prado Montes de Oca E, Ochoa-Ramirez LA, Ramirez M, Magallon-Zazueta LG, Gonzalez-Beltran MS, Cazarez-Salazar SG, Rangel-Villalobos H, Velarde-Felix JS. DEFB1 5'UTR polymorphisms modulate the risk of HIV-1 infection in Mexican women. Curr HIV Res. 2014;12(3):220-6. PubMed PMID: 25001249.

Gutiérrez-Amavizca BE, Gal A, Ortíz-Orozco R, Orth U, Prado Montes De Oca E, Gutiérrez-Amavizca JP, Figuera LE. Mutational analysis of the GLA gene in Mexican families with Fabry disease. J Genet. 2017 Mar;96(1):161-164. PubMed PMID: 28360401.

López Campos GN, Velarde Félix JS, Sandoval Ramírez L, Cázares Salazar S, Corona Nakamura AL, Amaya Tapia G, Prado Montes de Oca E. Polymorphism in cathelicidin gene (CAMP) that alters Hypoxia-inducible factor (HIF-1α::ARNT) binding is not associated with tuberculosis. Int J Immunogenet. 2014 Feb;41(1):54-62. doi: 10.1111/iji.12080. Epub 2013 Aug 16. PubMed PMID: 23953711.

Ochoa-Ramírez LA, Becerra-Loaiza DS, Díaz-Camacho SP, Muñoz-Estrada VF, Ríos-Burgueño ER, Prado-Montes de Oca E, Rangel-Villalobos H, Velarde-Félix JS. Association of human beta-defensin 1 gene polymorphisms with nonsegmental vitiligo. Clin Exp Dermatol. 2018 doi: 10.1111/ced.13697.

Prado Montes de Oca E. 2017. Antimicrobial Peptide Elicitors (APEs) and inhibitors (APIs): challenges and opportunities in personalized medicine. Nov Appro Drug Des Dev 2 (1): 555580.

Prado Montes de Oca E, Li W. Human β-defensin 1 (DEFB1) allele and genotype frequencies probably impact on ethnic susceptibility to atopic dermatitis. Int J Dermatol. 2013 Jan;52(1):115-7. doi: 10.1111/j.1365-4632.2010.04853.x. PubMed PMID: 23278620.

Prado Montes de Oca E. Antimicrobial peptide elicitors: new hope for the post-antibiotic era. Innate Immun. 2013 Jun;19(3):227-41. doi: 10.1177/1753425912460708. Epub 2012 Nov 16. Review. PubMed PMID: 23160387.

López Ávalos GG, Prado Montes de Oca E. Classic and new diagnostic approaches to childhood tuberculosis. J Trop Med. 2012;2012:818219. doi: 10.1155/2012/818219. Epub 2012 Mar 12. PubMed PMID: 22529869; PubMed Central PMCID: PMC3317187.

Prado Montes de Oca E. Human polymorphisms as clinical predictors in leprosy. J Trop Med. 2011;2011:923943. doi: 10.1155/2011/923943. Epub 2011 Dec 18. PubMed PMID: 22220182; PubMed Central PMCID: PMC3246779.

Prado Montes de Oca E. Human beta-defensin 1: a restless warrior against allergies, infections and cancer. Int J Biochem Cell Biol. 2010 Jun;42(6):800-4. doi: 10.1016/j.biocel.2010.01.021. Epub 2010 Jan 25. Review. PubMed PMID: 20100591.

Prado Montes de Oca E. Antimicrobial peptide elicitors: a potential strategy against infections. Gac Med Mex. 2009 May-Jun;145(3):241-3. PubMed PMID: 19685832.

Fernández-Grijalva, A. et al. Alpha 2HS-glycoprotein, a tumor-associated antigen (TAA) detected in Mexican patients with early-stage breast cancer. Journal of Proteomics 112, 301-312.

Flores-Saiffe Farías A, Herrera López EJ, Moreno Vázquez CJ, Li W, Prado Montes de Oca E. Predicting functional regulatory SNPs in the human antimicrobial peptide genes DEFB1 and CAMP in tuberculosis and HIV/AIDS. Comp Biol Chem 59 PtA:117-25.

Prado Montes de Oca E. 2014. The potential of antimicrobial peptide inhibitors (APIs) and elicitors(APEs) in leprosy treatment. In book: leprosy: Epidemiology Treatment Strategies and Current Challenges in Research, Edition: First, Chapter: The potential of antimicrobial peptide inhibitors (APIs) and elicitors (APEs) in leprosy treatment, Publisher: Nova Publishers, Editors: Roger S. Koop, pp.71-91.

Pelallo-Martínez NA, Prado Montes de Oca E, Santacruz-Esparza E, Gaspar-Ramírez O. Expression of genes associated with hematological malignances in children exposed to benzene. Toxicol Lett 259S (2016) S73-S247.

Solicitudes de Patentes

62/412,140 (USA) 2016 Bioinformatic system and method for candidate regulatory single nucleotide polymorphisms selection
MX/a/2015/002594 Lámpara de UVA y UVC para el tratamiento de enfermedades infecciosas y cáncer de piel.

Prensa

Videos LAMPER

Proyectos

2018 Laboratorio Nacional de Medicina Personalizada (consolidación) LN-293405 Fondos especiales CONACYT.

Patentes e Innovaciones

PCT/MX 2014/000161 Proceso para obtener una molécula que sirve como elicitor de péptidos antimicrobianos.
MX/a/2013/012160 Proceso para obtener una molécula que sirve como elicitor de péptidos antimicrobianos.
MX/a/2014/004496 Proceso para obtener una molécula que sirve como inhibidor de péptidos antimicrobianos.

Estrategia Técnica

Predicción in silico de variantes genéticas funcionales empleando nuestro software SNPClinic v.1.0 (patente en proceso)
Diseño y optimización de ensayos de genotipado por PCR-tiempo real

Ventajas de trabajar con nosotros

Resultados de acuerdo con las guías actualizadas de Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC®, USA)
Certificación ISO 9001:2008 otorgada en septiembre 2017 para servicios especializados LAMPER y renovación para formación de recursos humanos e investigación (ISO 9001:2015 por otorgarse). Preparando certificación ISO15189.
El SNPClinic es un software propio con la más alta especificidad a nivel mundial (84,6%) en la predicción de SNPs regulatorios.
Enfocado en la (s) línea (s) celular (es), enfermedad (s), origen (s) étnico (s) y frecuencias alélicas de la (s) población.
Una forma asequible y más rápida de elegir variantes genéticas para continuar los estudios preclínicos / de investigación.
14 años de experiencia en genotipado por PCR en Tiempo Real.